中文

English

基因编辑效率检测揭秘:尊龙凯时为您解析五大方法

发布时间:2025-07-25   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在本期中,我们将深入探讨CRISPR/Cas系统在生物医疗领域内的编辑效率验证技术,为您在基因编辑实验的最终确认提供支持。基因编辑效率简单来说,就是成功完成目标基因编辑的细胞或样本在总细胞或样本中所占的比例。这一比例直接反映了基因编辑工具的有效性,无论是在科研探索还是在基因治疗、生物制药等实际应用中,精确验证基因编辑效率都是不可或缺的环节。

基因编辑效率检测揭秘:尊龙凯时为您解析五大方法

市场上最基础的基因编辑检测工具——T7核酸酶I(T7Endonuclease I),如同一位敏锐的“侦察兵”,能够特异性识别并切割不完全配对的DNA序列。它通常用于ZFNs、TALENs和CRISPR/Cas9等技术所引发的基因突变鉴定。当通过基因编辑技术成功获得插入或缺失突变基因序列时,基因编辑后的DNA与野生型DNA混合后变性再进行退火,这一过程将导致野生型DNA单链与编辑后的DNA单链之间的错配,形成异源双链DNA结构。在此过程中加入T7核酸内切酶I,就能够特异性识别这些错配并在错配位点附近完成切割。借助琼脂糖凝胶电泳,您便可以直观地确认基因编辑效率的有效性。

尊龙凯时的T7Endonuclease I(Cat#M017)能够有效识别ZFNs、TALENs及CRISPR/Cas9等编辑后产生的突变体,具有高效的切割效率,是基因编辑检测的最佳选择。

在实验中,我们实现了将不同Cas9/sgRNA复合物通过电转方式递送至293T细胞。经过48小时的培养后,收集细胞并提取基因组DNA。使用T7Endonuclease I进行检测的结果表明,在相同条件下,尊龙凯时的Cas9蛋白的切割效率明显优于其他品牌,同时也证明了T7Endonuclease I有效的基因编辑效率检测能力。

在实验步骤中,首先取转染后的细胞培养48至72小时,随后收集细胞以提取基因组DNA(突变体DNA)。接着,以突变体DNA和野生型DNA为模板,使用高保真PCR(2×FastPfuMasterMix(QuickLoad),Cat#E035)扩增靶基因编辑区域。请注意,突变位点应避免位于片段中间,以便于从切割后的条带进行区分。

在PCR结束后,将0.5μl T7Endonuclease I酶加入PCR产物中,37℃孵育15-30分钟,随后立即加入DNA loading buffer终止反应。混合后,65℃保温10分钟,并最终通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切结果。

基因编辑过程中通过靶基因引入的插入或缺失,可以直接提取基因组DNA并扩增靶基因附近片段。结合PCR分析,如果编辑后位点检测到了双峰或杂峰,则表示成功实现了有效的基因编辑。

此外,尊龙凯时还提供适配NGS测序的多种通用型接头,为更加精准的基因编辑效果评估提供支持。质谱分析法通过测定生物分子质荷比以解析其结构,在基因编辑检测中,同样具有重要的应用。基因编辑后的细胞或组织样本首先提取蛋白质,并经过纯化与酶解处理,将其转化为肽段混合物。通过电喷雾离子化(ESI)或基质辅助激光解吸离子化(MALDI),实现肽段的气态离子化,进而使用质量分析器对不同质荷比的离子进行分离并生成质谱图。通过与数据库中已知蛋白质质谱图的比对,可以推导出蛋白质氨基酸序列的变化,从而间接反映基因编辑对蛋白质的影响。

流式细胞术则是基于细胞的光学特性与荧光标记的检测技术。将基因编辑后的细胞样本制成单细胞悬液,驱动细胞依次经过流动室与激光束相交,激发出荧光信号并产生散射光。若基因编辑使细胞表达特定标记蛋白,结合特异性抗体后,细胞会发出荧光信号。通过分析荧光和散射光信号,能够量化基因编辑成功表达目标蛋白的细胞比例,实现对细胞群体的多参数定量分析。

在下一期中,我们将专注于基因编辑实验操作过程中脱靶问题的解决方案,通过优化编辑工具与实验条件,逐步提高基因编辑实验的成功率。敬请持续关注,与我们一同在基因编辑领域奋勇向前!尊龙凯时为您提供全系列基因编辑相关产品的优质解决方案,欢迎您联系官方后台申请试用。