2019年11月，加利福尼亚大学旧金山分校的研究团队在《Nature Medicine》上发布了一项关于肠道病毒感染引发儿童急性无力脊髓炎（AFM）的研究。这项研究运用了PhIP-seq技术和病毒组抗原库，对42名确诊为AFM的儿童和58名其他神经系统疾病的儿童脑脊液样本进行了检测，筛选出与AFM病因学相关的病毒特异性抗体。结果显示，AFM患者组中肠道病毒抗体的浓度显著高于对照组，并通过ELISA验证了这一发现。这些结果表明，肠道病毒感染可能是大多数AFM病例的病因之一，为未来针对肠道病毒相关的AFM进行有效的临床诊断提供了重要的线索。

AFM自2012年在美国首次被发现以来，已导致超过500名儿童受到影响。在每两年的爆发周期内，伴随着肠道病毒EV-D68型和EV-A71型的传播。然而，AFM的具体病因至今仍不明确，因为仅在不到50%的患者样本中能够检测到肠道病毒，而在大约2%的AFM儿童的脑脊液中找到肠道病毒核酸。因此，研究团队担心AFM可能由尚未被识别的病原体或继发性免疫反应引起。为了确定AFM的发病机制，研究者利用PhIP-seq技术对AFM儿童及其对照组的脑脊液样本中的病毒抗体进行全面分析。这一高通量技术能够一次检测数百种病毒的特异性抗体，并通过ELISA进行验证。

研究发现，在AFM患者组中，小RNA病毒（Picornaviridae科）中的肠道病毒抗体响应显著高于对照组。此外，数据分析显示，免疫原性的抗原肽段源自肠道病毒基因组中的多个蛋白质。PhIP-seq技术的序列分析不仅发现了已知的线性表位序列，还揭示了新的线性结合表位。通过对EV病毒VP1蛋白进行ELISA验证，结果显示，AFM组中大多数脑脊液样本能够检测到EV信号，这与PhIP-seq的检测结果高度一致。

PhIP-seq技术，即噬菌体免疫沉淀测序，是一种高通量的抗体谱检测方法，结合了噬菌体展示技术、抗体免疫沉淀和高通量测序。它能够提供对数十万种抗原的抗体检测，全面描绘血清抗体谱，为免疫相关研究提供了强有力的工具。该技术首先通过生物信息学将目标抗原切割为重叠肽段，然后合成相应的DNA并包装成噬菌体库。当样本血清与这该库孙孵育后，利用ProteinG/A磁珠富集特异性抗体的噬菌体，接着进行PCR扩增、建库及测序，从而解析出抗体表位谱。

上海抗码芯瑞生物科技有限公司（简称“抗码芯瑞”）由上海交通大学的知名教授领衔创立。公司在蛋白组和抗体组领域深耕超过20年，专注于先进抗体组学技术方法的开发与成果转化。我们建立了PhIP-seq技术平台，定制六大抗原组库，并提供定制化抗原建库服务。抗码芯瑞致力于为抗体组学研究提供高通量筛选、数据分析和后续验证的综合技术服务，成为生物医学领域可靠的伙伴。

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