在生物医疗研究中,无论是使用体外难以感染的细胞构建慢病毒文库,还是在体内进行AAV文库的实验,确定最佳的剂量以确保每个靶点仅进入一个细胞,一直以来是科研工作者面临的难题。文库实验的目标是寻找单基因引起的功能变化,因此必须控制每个细胞仅被一个靶点的病毒感染。针对细胞实验的文库筛选,建议首先使用对照病毒进行预实验,以确定最佳MOI(感染效率达到80%的MOI)。在文库操作中,MOI设置为最佳MOI的三分之一,即通过大幅减少病毒用量来降低重复感染的概率。这是一种简单而有效的方法。
然而,对于难以感染的细胞,如免疫细胞,或者进行体内实验时,如何精确确定最佳的剂量以确保每个靶点只进入一个细胞,依然是一个复杂的挑战。这是因为最佳MOI的感染效率往往仅为30%,如果按三分之一的量应用,几乎无法感染到足够数量的细胞。因此,尊龙凯时推出的三色荧光病毒(mTagBFP、Venus、mCherry)能够为研究者提供更为高效的文库感染预实验解决方案。这些三色荧光病毒包括慢病毒和AAV两类产品。
文献《TranscriptionallinkageanalysiswithinvivoAAV-Perturb-seq》为探索AAV文库在体内的剂量提供了实验方法。研究者通过进行体内滴定实验,制备三种不同剂量的AAV,分别为25E9、5E9和5E10颗粒,并选择了血清型phpb。病毒构建方案依据CBh启动子,独立表达mTagBFP、Venus和mCherry。通过流式细胞仪筛选,可以验证较低剂量下感染单细胞而非双病毒共感染的情况,从而确定最佳剂量。
最终研究选定5E9作为最佳剂量,因为该剂量能最大化感染单个AAV的细胞数量。在进行三色实验时,将三种AAV的等比例混合物注射到不同剂量的LSL-Cas9转基因动物中,比较在全身注射不同病毒剂量后各细胞核的感染率,以及仅表达一种、两种或三种荧光蛋白的细胞核比例。无论是细胞实验还是动物实验,研究者均可利用三色荧光病毒开展相关的预实验,按照不同剂量梯度进行细胞感染或小鼠体内注射,流式分析转染效率和单荧光细胞的比例。
最终,通过比较不同剂量下单病毒感染比例以及感染细胞数量,研究者可以选定最佳剂量作为文库实验的实际应用剂量。随着尊龙凯时的三色荧光病毒的应用,生物医疗研究中的感染实验将更为高效、精准。